昨年度の全日本吹奏楽コンクールに出場を果たした北宇治高校吹奏楽部。 2年生の黄前久美子は3年生の加部友恵と、4月から新しく入った1年生の指導にあたることになる。 全国大会出場校ともあって、多くの1年生が入部するなか、低音パートへやって来たのは4名。 一見すると何の問題もなさそうな久石奏。周囲と馴染もうとしない鈴木美玲。そんな美玲と仲良くしたい鈴木さつき。自身のことを語ろうとしない月永求。 サンライズフェスティバル、オーディション、そしてコンクール。 「全国大会金賞」を目標に掲げる吹奏楽部だけど、問題が次々と勃発して……！？ 北宇治高校吹奏楽部、波乱の日々がスタート！

本作の舞台は、劇場版史上初となる海外・シンガポール！ 19世紀末に海底に沈んだとされる世界最大の宝石・ブルーサファイア“紺青の拳”を巡り、コナンと怪盗キッドが、リゾートホテル「マリーナベイ・サンズ」で起きた殺人事件やシンガポールの巨大な陰謀に巻き込まれていくストーリー。京極と怪盗キッドは、過去に京極の恋人・園子を巡り対決したこともある因縁の関係で、劇場版で京極は怪盗キッドの行く手を阻むキーパーソンとして登場する。コナン、キッド、京極の三つどもえのバトルも展開するという。

　　全世界被产业革命的浪潮所席卷，从近世即将进入近代之时，突然，不死的怪物出现了。不击穿其被钢铁皮膜所覆盖的心脏就不能杀死的怪物，以及被其所啃咬的人类死后，会复生成为怪物再度袭击人类。被取名为“尸(卡巴内)”的怪物爆发性地增殖，不久就遍布了全世界。 　　极东岛国·日之本，立于前线与“尸”正面对抗的装备着厚实装甲的蒸汽机关车(通称·骏城)之一——甲铁城。依靠甲铁城生存下来的生驹与同伴在“尸”与人的攻防战地——面日本海的废坑站「海门」，与玄路、虎落、海门的民众组成了“联合军”，定下击退“尸”的策略。 　　期间，生驹发现海门的“尸”有着被统治并采取着集体行动的特征。将此信息报告给联合军的生驹却并未被理睬，反而被讥讽了自己的“尸人(卡巴内利)”身份。因怒火而失去了冷静的生驹决意单身进入敌方阵营。 另一方的无名，对一直以来支撑着自己的生驹萌芽了前所未有的感情。这时又传来了生驹打算单身一人闯入敌地的消息——。 　　与“尸”的新的战斗、以及无名与生驹的命运将会如何发展——！？