トチローとハーロック、そしてシヌノラのいつ果てるとも知れない旅は続く。トチローとハーロックはアメリカに漂着した日本人の子供であり、幼い頃に白人によりイエロークリークの集落を追われちりぢりになった同胞を探すために旅を続けていた。方々で日本人にコンタクトを試みるが接触はままならず、様々な妨害を受ける。その一方でシヌノラの真の目的が日本民族の抹殺と知るも、トチロー達は豪放にも3人旅を続けるのだった。旅先で出会った子供達の死を目の当たりとし、生き残った同胞が日本へ向かった事を知ったトチローは日本への旅を決意する。シヌノラの体に己の子を託し、ハーロック達とニコヤカに笑いながら別れ、トチローは単身ガンフロンティアを船出するのだった。

少女向醒目        结城家的双胞胎兄妹赖和郁从小就感情笃深，哥哥赖发誓要娶妹妹郁为妻，只是孩子们的童言从来都未被当真过。 　　就这样兄妹俩到了半熟的国三之年，赖越来越无法控制自己对妹妹的恋意，决定远走他乡报考外县的高中。妹妹的好友友华一直深爱着赖，并对赖进行了大胆的表白，处于混乱中的赖渐渐不知所从…… 　　赖在友华和郁之间摇摆不定，然而始终无法摆脱对妹妹的爱恋。 　　随着毕业的日子一天天临近，感觉到哥哥即将离去，郁的心境起了微妙的变化，从一直被动接受，开始主动追求对哥哥的爱，大声喊出希望赖成为只属于自己的人，兄妹二人终于就这样结合了在一起…… 　　注定了的，这禁忌的爱，对赖和郁来说仿佛根本就没有前途，只是两个人还是要走下去，以一种不为人所知，也不为旁人所理解的方式……

西暦20XX年、日本海溝付近で原因不明の海難事故が立て続けに発生した。 政府から極秘の依頼を受けた沖海洋研究所の所長・沖重造と副所長の沖五郎は、深海探査艇で調査を開始するが、謎の潜水艦に襲撃され、行方不明になってしまう。重造の孫であり、五郎の弟でもある沖進は、二人からライフル“SS-99”と地下工場の鍵を渡されていた。研究所に侵入した工作員たちに捕らえられ、地下工場に連れて行かれた進は、そこでこれまで見たこともない超巨大潜水艦を目にする。 工作員たちの正体は謎の組織海洋帝国。進はこの超巨大潜水艦「スーパー99」と共にヘル・デスバード率いる海洋帝国との戦いへと臨んで行く。

2001年にテレビ東京で放送、全13話。主人公名が古見浩一から神谷浩一（かみや こういち）に変更され、遠縁の子（表向きの理由）として古見家で育てられたという設定になっている。