省吾達の帰還から数百年が経った時代。人々はコンピューターシステムに支配された街「エデンシティ」で暮らしていた。それは、かつての人類の過ちを繰り返さない為に取られた手段だった。しかし、その支配を嫌ったレジスタンスによる反攻作戦が開始される。 そして明らかになった支配者ウォン・ダイの正体は、あの矢作省吾だった。地球に帰還した際、彼を7Gのオペレーターと認めなかったクリエーター達は、バーチャルではなく人間であるオリジナル・イヴと彼との接触を恐れ、システムの操り人形ウォン・ダイと化してしまったのだった。 省吾はその支配から開放された直後、後を本作の主人公であるエイジ・タカナカに託して死んでしまう。それを知ったイヴは単身、A.D.A.M.へ向かう。人々を救う為……。

省吾がB.D.に敗れ去り、何処へともなく去って半年後。軍に智美の殺害容疑を掛けられたという理由もあり、新たな友人のライトニング率いる暴走族「TRASH（トラッシュ）」の元に身を隠していた省吾は、半年ぶりに由唯に再会する。その頃、街では軍に支配されたバハムートにより軍の広告塔と成り果てていたイヴを通して、人々を戦争に駆り立てるメッセージが連日流されていた。しかし、実はバハムートは完全には軍の管理下に落ちてはおらず、本来のイヴとも呼ぶべきもう一人のイヴ（軍によって作り出されたものではない、以前同様のイヴ）が現れ、7Gのオペレーターである省吾に対し、自分にコンタクトして欲しいとの呼び掛けを続けていた。省吾は半年間自分を待ち続けた由唯のわだかまりを身と心で解いて想いを伝えると、本来のイヴに会う為、そして彼女が何を自分に伝えようとしているのかを知る為、TRASHの助けを借りる。 その頃、デザルグは本格的なMZ侵攻を開始していた。MZ側の一部が極秘裏に試みていた平和的接触も空振りに終わり、迎撃に出た最新鋭艦FX-101とその護衛部隊も、デザルグの圧倒的な戦力の前には為す術もなく壊滅してしまう。一方、軍の手でプロトガーランドとして蘇っていたガーランドを入手した省吾は、軍の追跡をかわしながらバハムートに向かう。軍の攻撃に一人、また一人と仲間が犠牲になっていき、遂にはガーランドも大破してしまうが、省吾は軍の追撃で負傷した由唯と共に、やっとのことでイヴの元に辿り着いた。 イヴの言葉に省吾が、省吾の言葉にイヴが揺り動かされる…イヴの質問に対して自分が今したいこと、そして大人というのは汚い人々だ、という気持ちを話した省吾は、「自分がなりたかった大人になればいい」という返答をイヴから受け取った。傷の具合が思わしくない由唯をイヴに預けた省吾の眼前には、あのB.D.が再び現れる。半年前の出来事が蘇り、怒りに任せて飛びかかる省吾。B.D.が現れたその意図は!?　一方、遂にデザルグの自動攻撃弾の侵入を許してしまった市街地では、軍が一般人を避難させようと試みていたが、作業は遅々として進んでいなかった。 やがてイヴは、「ファイナル・プロテクション・モード」を発動させる。イヴの最後の歌声が響き渡る中、人々、建物、自動攻撃弾…全てを巻き込みながら、1980年代の東京は崩壊する。そんなMZとデザルグに月の防衛システム「A.D.A.M.」は、地球帰還の条件を満たしていないという結論を出し、一斉攻撃を始めた。しかしイヴは、その影響が及ぶ寸前にバハムートをMZから切り離し、省吾達を脱出させることに成功していた。 崩壊していくMZとデザルグを背に、バハムートは地球へと降り立つ。中から出てきた省吾達の目前には、再生した地球の大地が広がっていた…。

潜伏于地底的秘密结社铁甲龙，二十年前为了征服世界而以其超科技开发了巨大的八卦机器人，但组织内的天才科学家木原正树的背叛使铁甲龙的计划遭到坏灭的打击，其中最强的天之志雷马落入最终护卫的手中，木原也被射杀。 二十年过去了，铁甲龙再度来袭，被最终护卫绑架的天之志雷马预定驾驶少年秋津正人坐上了被称为天的最强机体……

1980年代の東京。人々はその「一番良い時代」を謳歌していた。主人公の矢作省吾もその一人である。街中をバイクで駆け抜け、ふと出会った美少女・高中由唯の存在に一喜一憂し、若さゆえの有り余る力で拳を天に向かって突き上げる…そんな日常を過ごしていたある日、友人の中川真二にとある地下駐車場へ呼び出された省吾は、真二が盗み出してきた巨大な試作用軍用バイクを見せられる。今までに見たこともないそのバイクの名は、ガーランド。しかしそこに軍関係者が現れ、真二を射殺してしまう。ガーランドを彼らの手に渡すまいとした省吾は必死に逃走する。やがて、時代の大きなうねりに翻弄されてゆくとも知らず・・・。 ガーランド（7G）のオペレーターとなった省吾は、マスメディアを使ってガーランドを世間に公表しようと、人気絶頂のアイドル時祭イヴの番組にTV電話で出演するが、軍の情報操作によって公表できなかった。焦る省吾に、由唯の友人であり映画監督志望の村下智美は、ガーランドを使って自主制作映画を撮ると言い出す。ロケ地を探しているうちに白バイに追跡された2人は、やがて全く知らない場所へと迷い込んでしまう。そこは街の地下にある広大な廃墟の街であり、その中心にそびえ立つ巨大な円錐状の建物・バハムートが、遥か上空にある廃墟の街と繋がっている摩訶不思議な空間であった。このまま二人で行くのは危険と感じた省吾は、智美を帰らせて自分一人で更に調査を進めるが、予感は的中。軍のパトロール隊と交戦になったガーランドは、遂には隔壁をブチ破り、宇宙空間にまで飛び出してしまう。その際、省吾は交戦相手の一人が乗り込んでいたロボット・ハーガンを、襲ってきた相手とはいえ見殺しには出来ず、咄嗟に助けていた。 廃墟の街へ戻れた省吾の前でハーガンから降り立ったのは、軍の若き将校・B.D.。彼はバハムートを自分の管制下に置き、なおかつ宇宙から来る敵・デザルグも制圧しようと目論んでいた。更にB.D.は、省吾達が1980年代と思っている時代より実際には5世紀以上（後の年表では約9世紀）経過している事、そしてデザルグの脅威が迫っている事を省吾に語る。信じられない現実と、ファシズム国家の建設を目論むB.D.に反感を覚えた省吾は、苛立ちながらその場を後にするのだった。 やがて、バハムート端末であるガーランドにSOSを求めてきたイヴによって更なる真実と、彼女の正体も知ってしまった省吾は悩み続ける。そして由唯と一夜を共にし、この世界がおかれた現実を彼女に語るのだった。一方、軍はバハムートの制御を自らの手中に治めた上で、デザルグとの戦争準備を始めていた。それに伴い、街は戦争色に染まっていく…あのイヴさえ、軍の広告塔と化すほどに。 省吾が由唯とのささやかな幸せに救いを見出そうとしていた矢先、軍は更なる機密漏洩を阻止する為、バハムートの存在を知るもう一人の一般人である智美を暗殺。とうとう決意した省吾はガーランドを駆って、単身バハムートへの突撃を仕掛けるが、B.D.はハーガンで立ち塞がると、今度はガーランドを冷酷に叩きのめす。辛うじて生きながらえた省吾は、朝焼けの街を満身創痍で一人、何処かへと去っていくのだった…。

西元2050年, 不明生命体INVADE突然出现并将地球占领, 半数的地球人逃到火星......30年后的2080年, 在火星残存的地球人类发动了"第一次地球降下作战" , 可惜完全失败. 吸收了这次失败的教训, 3年后的2083年人类发动了"第二次地球降下作战", 故事亦由第21机甲战斗中队的年青军人STICK降落地球后展开.... .. 自从1984年美国金合声公司从龙之子购得36集《MACROSS》的版权，并根据当地引进剧不能少于65集的规定，因此购得另外两部龙之子制作的动画《机甲创世纪》《超时空骑团》以剪接和修改的方式重新编写、重新设定，赋予人物西方化的语言、思维以及名字，并重新编配了所有配乐和插曲，终于将三个毫不相乾的系列焊接成为一个统一的整体，这样便诞生了这部动画历史上著名的《太空堡垒》。